糖尿病关联基因及变异研究

华大与来自9个丹麦研究机构组成的科学研究联盟启动了LUCAMP计划。糖尿病关联基因及变异的研究是其中的一个子项目。LUCAMP计划旨在通过开展一系列科学研究和临床研究，推动研究成果向临床转化的进程。

详述

近年来，利用全基因组芯片技术的复杂疾病全基因组关联分析取得了重要进展，定位了与肥胖、II型糖尿病、心肌梗死等。然而，到目前为止找到的19个代谢类疾病相关位点仅仅能对这些疾病遗传因素的10%做出解释。而且，这些芯片上的位点，只包含基因组中的常见变异的80%（次要等位基因频率>5%），对于罕见变异则覆盖率更低，大约只有1%。虽然最新的基因芯片已经包含了基因组上大约200万个SNP，但是仍然有许多的基因组变异无法被检测。

2006年，在DNA测序领域出现了许多技术突破，日产数据量达到Gbp级别，且成本大幅度下降。为鉴定与复杂疾病相关的新的遗传变异提供了契机，使人们有可能找到与II型糖尿病及相关代谢类和心血管疾病有关的另外90%风险位点。

目前推出的全基因组编码区重测序是在当前技术条件下对测序成本和研究效果的一个平衡。由来自欧洲和中国的10个研究机构组成的LuCAMP协作组，已经启动了一项外显子测序项目，计划将对3000个内脏肥胖病人与3000个对照健康人进行全外显子测序。其中3000个病人的表型界定为由II型糖尿病和原发性高血压引起的内脏肥胖。通过这项计划，计划将：
（1）鉴定出新的常见和罕见突变；
（2）检验这些突变在病人组与对照组中频率的差异。目前已经找到的1536个在疾病对照组中差异最显著的SNP位点，将通过基因分型的方法进行重复。

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